VARIA-GEN
En las actividades acuícolas, es común la producción de semilla propia y su uso en nuevas etapas de producción. Esta práctica conlleva a que una población cultivada incremente con el tiempo la frecuencia de genes relacionados a caracteres adversos a la productividad, lo que se denomina el incremento de consanguineidad. En términos genéticos, la continua práctica de cruzamientos consanguíneos conduce al incremento de la homocigosidad y pérdida de diversidad genética.
Nosotros le ofrecemos el servicio de diagnosticar la diversidad genética de la especie que cultiva. Podemos evaluar la diversidad genética de una de las tres maneras:
- Diversidad maternal. Analizamos marcadores cuyo modo de transmisión es matrilineal que se ubican en el genoma mitocondrial. Nos permiten establecer el número mínimo de hembras que ha dado origen a la población cultivada, valores de diversidad cercanos a uno nos indicarían un alto grado de diversidad relacionada a hembras.
- Diversidad genómica. Analizamos marcadores que se ubican en el genoma nuclear, cuyo modo de herencia es biparental y altamente variables que no permiten establecer valores de diversidad genética en su población de cultivo. Este servicio puede asumir diferentes estrategías que se orientan a:
- Monitorear la diversidad genética de su cultivo a través de las generaciones.
- Seleccionar a los individuos con mayor diversidad genómica para realizar cruzamientos selectivos.
- Comparar la diversidad genética con otros cultivos a fin de establecer que población sería la mejor opción para realizar cruzamientos que incrementen la diversidad.
- Orientar programas de repoblamiento de especies con la finalidad de mantener o incrementar la diversidad genética de poblaciones naturales.
- Formación de un banco de reproductores asistido por marcadores moleculares. Este comprende un estudio completo de los individuos de su cultivo. Comprende la búsqueda de genes relevantes a productividad y cuantificar los niveles de producción de las formas alternativas del gen relacionadas a producción a fin de seleccionar aquellos individuos que posean la forma alternativa que nos favorece comercialmente sumada a una mayor diversidad del genoma, formando así un banco de individuos con solo sólo el mejor fenotipo sino con el genotipo más variable. Asegurando una alta heredabilidad, baja variabilidad del carácter fenotípico deseado y alta variabilidad genética poblacional.
- Conocer la diversidad genética, los niveles de flujo génico, la estructura genética poblacional de los actuales recursos que se hallan en un área de actual impacto. La diversidad es un indicador respecto a la oportunidad que tiene una especie de adaptarse o sobrevivir a un cambio en su medio, el flujo génico permite evidenciar fenómenos migratorios antiguos grabados en la memoria del ADN y así preveer si la actividad tendrá un impacto trascendente en los procesos de especiación de la especie y la estructura genética permite identificar el número de unidades genéticas poblacionales o reservorios de diversidad genética de una especie en un territorio geográfico así como identificar los límites entre estos, lo que permite limitar el impacto a una subpoblación y no a toda en su extensión.
DETECT-GEN
La identificación de microorganismos tiene un amplio rango de aplicaciones desde la bacteriología médica hasta los estudios ambientales. Este servicio comprende la extracción del material genético del microorganismo y mediante una técnica de amplificación génica “in vitro” se obtienen varias copias del gen de interés, en este caso una secuencia de ADN que posee un código semejante al código de barras que permite la identificación molecular de un taxón.
Levantamiento Molecular de Inventario de Especies.
Los inventarios biológicos evalúan la presencia física del organismo y empleando la experiencia de equipos taxónomicos para la correcta identificación de las entidades biológicas. Muchas especies de estos inventarios son catalogadas hasta el nivel de especie y se describen como especie sp. lo cual disminuye la representatividad de una base de datos. Adicionalmente los taxónomos expertos son pocos y las claves taxonómicas no se hallan para todos los grupos, esto conlleva a errores en la producción de inventarios biológicos. Existen especies que fenotípicamente son muy similares y son confundidas con taxones conocidos (especies cripticas) igualmente sumado al error humano durante el proceso. Se ofrece el servicio de autentificación genético molecular de especies usando los marcadores COI (para especies animales) y el core rbc-L, matK, e ITS (para especies vegetales).
El resultado ofrecido comprende para animales una certeza entre el 98 – 100% de tratarse de una especie biológica y en el caso de vegetales una certeza entre el 90 – 100%.
Metagenómica: Modelando la Comunidad Microbiológica en ambientes acuáticos y terrestres.
Nuestro servicio tiene como objetivo caracterizar la flora microbioma de un ecosistema. Usted puede elegir el ecosistema a caracterizar, este puede ser desde aquel que se halla en un sector de su tierra de cultivo, aquel que se halla en los límites de algún relave minero, el que se desarrolla en un cuerpo de agua, etc. Bajo la definición de ecosistema este considera un límite (ecotono) establecido por el hombre (en este caso el usuario). Este ofrece la ventaja de proporcionar una mayor información de la composición de la flora microbiana de un ecosistema en comparación al método tradicional (cultivos bacterianos) en los cuales solo se logra el crecimiento de los microorganismos que pueden desarrollarse en el medio utilizado permitiendo caracterizar una pequeña proporción de ellos. Con la metagénomica se puede lograr la identificación de cientos de microorganismos y de esta manera reconstruir la comunidad bacteriana del ecosistema estudiado no solo de forma cualitativa sino con estimaciones cuantitativas.
- Conocer la comunidad de microorganismos en un ecosistema antes de que esta sea sometida a un desequilibrio de causas antropogénicas nos brinda una línea base para actividades de monitoreo y seguimiento a futuro y algunos lograr caracterizar algunos microorganismos que permitan desarrollar biotecnología de recuperación o biorremediación.
- Las enfermedades en organismos acuáticos son desencadenadas por factores físicos, químicos o biológicos. Diferentes microorganismos suelen estar presentes durante el tiempo que dure la enfermedad, a medida que esta progresa otros organismos oportunistas se hacen presentes ocupando nichos en el organismo infectado causando diferentes complicaciones que pueden terminar en la muerte del mismo. Mediante este servicio se puede reconstruir la composición de la comunidad relacionado a la enfermedad.
Identificación Molecular de Patógenos en la actividad acuícola.
Las enfermedades en las truchas pueden surgir por una mala calidad de agua, deficiente limpieza de heces de las pozas, alimento contaminado, deficiencias nutricionales o golpes (traumatismo físico) que sufre el pez durante su manipulación. Nuestro servicio ofrece la alternativa de realizar un screening genético molecular de los posibles patógenos que estén presenten en su cultivo.
- Preventiva: Este servicio le permitirá prevenir o anticipar la presencia de patógenos que puedan afectar negativamente su producción, en este paquete le ofrecemos los siguientes servicios:
- Tamizaje de patógenos en la zona de cultivo: Realizamos un screening molecular que comprende la búsqueda de los patógenos más comunes entre virus, bacterias y hongos presentes en la fuente primaria de agua, tanques, agua, epitelio de individuos mediante monitoreos periódicos.
- Tamizaje de ovas o larvas: Adquirir ovas o alevines de otras piscigranjas, conlleva un riesgo para su cultivo. Las ovas comerciales son certificadas libres a determinados patógenos, pero acaso de los más comunes en nuestra región?. El tamizaje de estos lo previene del ingreso de estos patógenos.
- Causal: Realizamos una prueba molecular confirmatoria que permite la identificación molecular del patógeno causante de la enfermedad que se halle progreso en su cultivo o que ha desencadenado la pérdida de su producción. EL muchos casos no solo es suficiente la identificación de la especie causante sino de la cepa o variedad de la misma, la cual puede realizarse con técnicas genético moleculares
Lista de microorganismos detectados:
- Enfermedades virales: virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPN), virus de la septicemia hemorrágica viral (SHV), virus de la necrosis hematopoyética infecciosa (INH).
- Enfermedades bacterianas: enfermedad de la boca roja o yersiniosis (Yersinia ruckeri), enfermedad de agua fría o del pedúnculo (Myxobacteriums, Flavobacteriums, Chondrococcus), síndrome de mortalidad de alevines o de “anemia de los alevines” (Cytophaga psychrophila), enfermedad “el columnaris” (Chondrococcus columnaris), enfermedad bacteriana renal ó BKD (Renibacterium salmonarium), furunculosis (Aeromonas salmonicida), septicemia por Pseudonomas (Pseudomonas sp), vibriosis (Vibrio anguillarium).
- Enfermedades fúngicas: causadas por Saprolegnia ó Icthyophorus.
- Enfermedades causadas por protozoarios: Consultar.
- Otros: Si la empresa tiene la sospecha de un patógeno en particular, igualmente realizar la consulta vía correo.
Servicios Moleculares Microbianos.
Nuestro servicio de identificación molecular microbiana sirve de apoyo a la industria, academia, agricultura e estudios de line base ambiental. Sus resultados son analizados desde un enfoque de diversidad microbiana, taxonomía y ecología. Le aseguramos calidad, seguridad y confidencialidad para la identificación de cultivos de diferentes microorganismos como hongos, bacterias y levaduras. Después de haber culminada la identificación el cultivo original y las muestras de ADN, serán destruídos para mantener así la confidencialidad de los datos, a menos que se requiera el servicio de mantenimiento de cepas. La identificación se realiza con diversos tipos de microorganismo, con excepción de organismos patógenos humanos.
PRESER-GEN
Preservación de Microorganismo.
Podemos mantener sus cultivos de alto valor por largo tiempo, con la confidencialidad y el biomantenimiento de sus cepas. Pueden depositar sus microorganismos, así como su ADN en nuestro equipo a bajas temperaturas y en criopreservación. Comprende su reactivación y criopreservación periódica, así como el mantenimiento de las cepas originales.
Ofrecemos los siguientes servicios:
- Obtención de ADN genómico
- Secuenciamiento de 16S / 18S ARN ribosomal (fragmentos de 700pb aproximadamente) para bacterias.
- Secuenciamiento de ITS (fragmentos de 600pb aproximadamente) para hongos.
- Análisis filogenético.
- Preservación y Mantenimiento de Microorganismos.
{ 0 comentarios… add one }